Gitですでに管理下にある特定のファイルを無視したい場合はこんなコマンドで実現可能です。
git update-index --assume-unchanged [ファイル名]
実行したところ、「fatal: Unable to mark file」が表示され失敗したもよう。。。
[ファイル名]をフルパスに変更したら無事実行されました。
StackOverFlowさんいつもありがとう。
http://stackoverflow.com/questions/12920652/git-update-index-assume-unchanged-returns-fatal-unable-to-mark-file